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人力资源和社会保障部是全国博士后工作的主管部门，负责制定博士后工作的政策、规章、规划并组织实施。为有利于博士后工作的开展，1985年7月，国务院批准成立博士后科研流动站管理协调委员会（后更名为全国博士后管理委员会）。它由国务院人事、科技、教育、财政等有关部门的负责人和专家组成，负责对全国博士后工作中的重大问题进行研究和协调。全国博士后管理委员会主任由人力资源和社会保障部的领导担任。全国博士后管理委员会办公室设在人力资源和社会保障部专业技术人员管理司，主任由专业技术人员管理司司长担任。全国博士后管理委员会下设若干个学科专家组，每个专家组均由学术水平高、有名望、熟悉国内高等学校和科研机构情况的专家组成，主要任务是对申请设站的单位进行设站评审。专业技术人员管理司是博士后日常工作的综合管理部门，负责拟定博士后工作的政策法规并组织实施，指导协调全国博士后工作；组织开展博士后工作发展规划和年度计划并组织实施；负责博士后科研流动站和博士后科研工作站评审、评议工作；负责博士后公寓建设的监督管理工作；指导博士后表彰工作；负责博士后工作宣传和网络管理工作；负责博士后研究人员进出站的监督管理工作；制定博士后工作评估办法并组织实施；会同有关部门推进博士后工作国际交流；承担全国博士后管理委员会办公室有关工作。